Il est l'un des auteurs présumés des attentats de Londres, le 7 juillet 2005. Il serait mort dans le métro londonien au niveau de la station d'Edgware.

Mohammad Sidique Khan est aussi soupçonné d'avoir participé à la préparation de l’attentat de 2003 contre le Mike’s Place, un bar de Tel Aviv fréquenté par le personnel de l’ambassade américaine en Israël.